Consta de 6,022 hectáreas de bosques mesófilo de montaña, de pino y encino. En esta área han sido registradas 256 especies vegetales y más de 100 tipos de vertebrados, la gran mayoría, únicos de la región biótica neotropical del altiplano de Chiapas y de El Petén.

El 18% de esta superficie lo ocupan lagos y lagunas -52 en total- que van del color turquesa al negro, las rodean bosques de pino y encino entre otras especies del bosque mesófilo como el liquidámbar.

A causa de las intensas lluvias de la región, la disolución de calizas ha permitido que cada una de estas lagunas tenga características muy diferentes; como forma, tamaño y profundidad que en algunos casos oscila entre los 70 y 120 metros.